Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPACA9Q96E40 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms