Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms