Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMD3Q96D46 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMD3Q96D46 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms