Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM52Q96A61 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms