Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms