Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCAMP4Q969E2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms