Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP9XQ93008 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms