Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEO1Q92859 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms