Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN4Q92575 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms