Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF8

DEDD2, DNA-binding death effector domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEDD2Q8WXF8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEDD2Q8WXF8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEDD2Q8WXF8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms