Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHIPQ8WWQ0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PHIPQ8WWQ0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHIPQ8WWQ0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHIPQ8WWQ0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHIPQ8WWQ0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHIPQ8WWQ0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHIPQ8WWQ0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHIPQ8WWQ0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms