Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms