Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00612Q8N6U2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms