Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD35Q8N283 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD35Q8N283 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms