Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNE4Q8N205 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNE4Q8N205 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms