Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SYCP3Q8IZU3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms