Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms