Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD1L3Q7Z443 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD1L3Q7Z443 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms