Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms