Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms