Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms