Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms