Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms