Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF549Q6P9A3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF549Q6P9A3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF549Q6P9A3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF549Q6P9A3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms