Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms