Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102BQ68D86 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102BQ68D86 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms