Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF6Q5VXH4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms