Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD4Q5VX71 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms