Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM46CQ5VWP2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46CQ5VWP2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms