Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF3Q5VWG9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms