Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms