Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARFGEF3Q5TH69 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms