Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms