Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms