Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms