Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms