Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIDA1Q1XH10 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIDA1Q1XH10 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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