Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms