Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FXNQ16595 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FXNQ16595 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FXNQ16595 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FXNQ16595 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FXNQ16595 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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FXNQ16595 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FXNQ16595 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FXNQ16595 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FXNQ16595 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FXNQ16595 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FXNQ16595 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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FXNQ16595 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FXNQ16595 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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FXNQ16595 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FXNQ16595 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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FXNQ16595 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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FXNQ16595 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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FXNQ16595 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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FXNQ16595 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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