Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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