Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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