Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F4Q16254 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F4Q16254 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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