Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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