Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITSN1Q15811 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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