Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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