Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCEA2Q15560 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms