Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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