Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SF3A1Q15459 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3A1Q15459 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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