Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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