Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBFBQ13951 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms